就在王烨和和马交手的时候，远在木叶的三代目终于决定动手了！
因为武则天封印的关系，影级和超影级以上的强者根本无法随便对战，不过这也不是绝对的设定，其中有一个非常大的漏洞，这个漏洞就是大蛇丸和罗砂以及三代火影！
原因很简单，按照原本的剧情，大蛇丸是杀死罗砂的罪魁祸首，并且在中忍考核的时候，杀死了三代火影。也就是说，武则天对他们三个人其实是没有所谓的影级封印的。
故而，当团藏带着人马去追杀鬼鲛的时候，他可能不会死，因为鬼鲛和团藏身上都有封印，但是他好死不死地被引进了大蛇丸的巢『穴』中，那么大蛇丸就有了反击的理由了。
所有的影级以上的npc除了有一个封印以外，每个影级强者都有自己的自留地，也就是所谓的老巢，只要你呆在自己的老巢里面不『乱』跑，那么其他的人跑进你的老巢时，你的实力是完解封的。因此，团藏带着自己的手下闯入大蛇丸的老巢的时候，完就是自找麻烦。被杀了纯粹是活该，他太看得起自己了，也太将自己当一回事了，故而他就这么轻易地死翘翘了。
在他死后没多久，三代目就得到了消息，可是却一直都不敢确认而已。因为团藏的老巢也是团藏的自留地，万一自己闯进去了，发现里面还有一个盛时期的团藏，那岂不是给他送人头？三代目可没有这么傻，就算他也是出于开封状态的，但这并不是他拿自己的小命试探的理由。
为此，三代目多方打探团藏的消息，他需要得到更准确的团藏的生死消息。同时，为了增加自己胜利的筹码，他想到了刚刚出门的自来也和纲手。纲手的话，可能并不一定会被他喊回头，但是自来也的话，完没问题的。
就这样，在确认了团藏已经死亡，并且自来也也回到了木叶之后，三代目终于有了彻底回收根部的勇气！
当他带着人走进根部的时候，这里像是早就被废弃了一般，地上到处都是些『乱』七八糟的东西，房间内几乎就没有一个完整的物件，至于那些收藏在根部密室里面的文件也早已被人焚毁，也就是说，三代目到了这里并没有得到任何有用的东西，这将他气得啊！
怒气冲天的三代目从根部走了出来，直奔火影大楼，同时他还将木叶的影级以上的家主部喊道了办公室，包括两位火影顾问。
原则上，团藏死后，整个根部应该归属于火影的直系暗部，他们从根源上本来就是一体的。但是，在根部时间长了，有些人已经彻底忘记了自己的归属了，在团藏死亡以后，那些人彻底的得到了解放，同时解放的不仅仅是他们身体内的团藏留下的封印，还有他们的野心！
于是，当他们知道自己的首领已经死亡了以后，便秘密地撤出了根部自留地，同时也带走了大量的重要资料，至于那些还没有来得及被他们洗脑的人，则部命丧与根部自留地。这也是为什么三代目走进根部基地后看到那么多尸体的缘故。
说句不好听的，这些人的行为就等于背叛木叶，你说三代目怎么可能不恼怒？他更担心的是那些被带走的资料！鬼知道这些年团藏这个老阴比在根部留下了多少害人的资料？鬼知道他在根部留下了多少木叶方面的情报资料？要是这些东西被敌人得到了的话，那么后果不堪设想！
这些族长们也都是人精，一听到三代目说得这么严重，他们纷纷响应三代目的号召，回去召集更多的人力围剿这部分的根部余孽！
没错，他们已经将这批人定义为根部余孽了！
至于他们的目的，其实很简单，谁都想要成为第二个根部，或者说，谁都想要成为第二个志村团藏。只要他们得到并消化了那些资料，那么他们的家族就很可能会成为木叶第一家族，这样的机会，谁不心动？
可是，事情真的会如他们想的这般顺利吗？显然不是！
就在他们一个个昂首挺胸离开火影会议室的时候，他们可能还不知道，他们已经一只脚踏上了死亡之路，而且还带着整个家族一起走上了这条死亡之路！
“没想到，这么多人看不惯老头子我啊！看来我这个火影做得确实很失败嘛~啊？”
三代目现在已经不知道该说些什么好了，平时让他们这些人出力，他们一个个怂得像个什么似的，但是这次居然部都蹦踏出来了，就这么想要成为第二个团藏吗？
“卡卡西，给我盯好这些家伙，谁要是做出了些出格的事情，你就力出手，一个不留也可以！”
“可是……”
“放心吧，自来也会配合你的！”
“哎，我知道了！”
卡卡西带着阿凯离开了火影办公室，转寝小春和水户门炎已经被三代目这一系列的『骚』『操』作给吓到了：“猴子，你不可以这么做，团藏刚刚逝世，我们这个时候应该找到凶手，替团藏报仇，而不是斩了自己的手脚啊！”
“哼！”
三代目从抽屉里拿出一叠文件，将他们丢到了两个顾问的面前，“这是我以前犯过的错，现在我不想在犯错了！”
水户门炎拿起这叠资料，他只看了几眼就吓得浑身直哆嗦，一把将资料丢到了桌面上，还亏他原本就靠在桌子边上，不然准保这叠资料被他扔到地上去。
转寝小春有些不解，怎么只看了两眼就吓成这样了？她也拿起这叠资料，可是她看得还没有水户门炎多，立刻抛弃了这份资料，并且颤抖地问：“这上面记载的是真的？”
“你们真当我今天才收复根部吗？根部的那堆尸体中有部分是反叛者的，还有部分则是被反叛者杀掉的，那是因为我们去迟了！而这叠资料就是我从根部找到的！你看看，团藏他都干了些什么？不仅仅是团藏，这下面的还有些是记载了和团藏有过交易的那些族长们的资料！你看看他们干了些什么？我到今天才知道，原来团藏这么不辞劳苦地对付宇智波一族，为的居然只是宇智波一族的写轮眼！”