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乔飞拿起手机,直接拨梁晓慧的电话。

只响了一声,对方就接通了。

“174大神!额,不对……乔飞,什么事?”电话另一边的声音有些惊讶。

“有点事情请教你…”乔飞说道。

“什么?有事情要请教我?你这么快就在学习生物信息学了?不错耶!”声音从惊讶转为了兴奋。

“我是正在研究。”乔飞不想让她失望,先肯定的说道。

果然,电话那头一阵欢呼…

“现有有点事情需要你帮个忙。”乔飞接着说道。

“没问题。”梁晓慧斩钉截铁的承诺:“说吧!”

“对于我缺失的那段DNA,2.7kb的,我想知道这一段DNA序列上有多少个SNP,或者STR也行,我对NCBI这个库不太熟悉,怕自己查的信息不准。”

“好的,没问题,STR估计不会有的,因为这段DNA是外显子,一般不会有STR,SNP肯定会有的,我马上去确认。话说NCBI你怎么能不会用,这可是学生物信息学的基础,你要尽快掌握哈,过两天不忙了我去教你,包教包会…”

电话那头滔滔不绝的热情,让乔飞莞尔。

……

用那段DNA确定是否和蒋慕轩有关,必须知道这段序列上,有多少SNP位点或者STR信息。

因为人与人的DNA序列,有99.9%都是相同的,必须测定那些人与人之间不同的核苷酸位点,才能说明问题,这也是亲缘关系鉴定的技术原理。

乔飞问梁晓慧这段序列上的SNP与STR变异,就是为了找到这段序列上的不同,如果这些人与人之间不同的点,和蒋慕轩却相同,就能够证明了。

SNP,单核苷酸多态性,简单来说,指的是经常出现的单个DNA位点的变异,这和单点基因突变只有不到1%人群概率不同,这种变异广泛存在。

比如发现某个基因位点,有70%的人是TT型,有19%是CT型,有11%是CC型,这三种类型的人,出生的时候,没有明显的个体差异。

如果这个基因位点有99%以上的人都是同一类型,只有不到1%的人不一样,这属于基因突变而不是SNP变异,基因突变一般情况下,是会引起严重的疾病的。

从乔飞出生的2002年左右开始,世界范围内开始了针对SNP变异的广泛研究,发现了这一类的变异,虽然不会直接导致个体的差异,却会让人产生一些不同——患上某种疾病概率的不同。

就像上面的基因型,大部分人是TT型的,结果经过统计发现,CT型的人,比TT型的人,更容易患上糖尿病…

所以大概2008年左右,整个世界范围内,出现了大量针对SNP位点进行测序服务的公司,通过检测SNP变异,告诉受检者容易患上哪种疾病,提前预防…市场火热了十多年——京西商城上面的那些基因检测产品,都是此类。

而STR,是DNA的短串重复序列,是指的DNA序列上某些固定序列的重复,重复的数量,人与人之间也经常不同。

如5’—ATCGGAGAGAGAGAGACTAGTA—3’这段序列,STR指的就是其中的GA,重复了六次,而有些人是七次,有些人是五次,一般情况下,也不会引起个体太大的差异。

但是无论SNP还是STR,都可以作为乔飞鉴定的依据。

再次思考了一次自己的逻辑,乔飞觉得没有任何问题,果断的将自己具有2.7kb基因序列的全基因组数据,和蒋慕轩的基因数据,一起上传到梁晓慧做的程序中。

如果系统能够直接分析基因序列,就太好了,乔飞喃喃自语。

不过现在不用着急,系统以后会升级的,也许真的就会有这个功能也说不定,乔飞感觉对自己的系统,还是充满希望的,即使到现在也没搞清楚它升级的经验,到底是什么鬼。

乔飞直接从梁晓慧的程序里面进行设置,只比对那2.7kb的DNA序列——因为其他的DNA片段根本没有任何必要。

因为数据少,绿色的进度条几乎一秒钟,就跑到了尽头。

而显示的结果,则是——完全相同!

自己那缺失的2.7kbDNA片段,那段莫名其妙回到自己细胞中的DNA片段,果然和蒋慕轩的——一模一样!

乔飞十指交叉,顶着自己的下巴,等待梁晓慧查询的结果,因为还不确定这段DNA上是否有SNP,如果没有,那说明不了任何问题——因为如果没有的话,这段DNA序列,所有人类都是一样的。

理论上,平均每1000个DNA碱基对,差不多会有一个SNP位点,只是这段样本序列太短了,只有2.7kb,按照概率算,只有不到3个——位点太少的话,同样说明不了什么问题,因为,会有大量的人群重合。

乔飞就这样平静的等待,内心深处却有一丝复杂的感觉,既希望这段DNA序列中,SNP变异位点能够扎堆,能够直接证明这段DNA序列,的确来自蒋慕轩,又担心证明这个结论后,该如何面对这个结论——实锤了自己身体,和蒋慕轩的关系。

随着电话响起,乔飞接了起来,淡淡的问道:“已经查好了?”

“必须啊,你好好学哈,我发到你启明局系统了…你现在看看,我等你。”乔飞听到对方把手机放在了桌子上,发出一声清脆的碰撞。

打开启明局的通讯系统,果然发现了梁晓慧的邮件:

STR变异,没有,果然没有。

SNP位点,共计四个…

这个数量,有点差强人意,乔飞继续往下看:

四个SNP分别是rsAA45%AG40%GG15%

rsAT…

居然连基因频率也帮忙查到了,通过计算,乔飞马上得出了结论,这段2.7kb的DNA序列,和蒋慕轩相同的概率是8.32%。

8.32%,似乎,会有巧合的情况存在啊,乔飞喃喃自语,对这个数值很不满意。

因为SNP数量太少,导致和蒋慕轩这段基因相同的概率太大,有8.32%的人,会完全和蒋慕轩的这段基因一样,还是无法确定,自己的这段DNA序列,是否在8.32%的人群之中。

“喂,你看到了没?”电话那头传来有些焦急的声音,似乎是等乔飞等的太久了。

乔飞思考了一下,说道:“梁老师,我发给你一段2.7kb的DNA序列,您帮忙上面有没有突变。”

“老师”这两个字非常的受用,乔飞感觉电话的另一头热情急剧上升,连说没问题。

果然,情商高好办事,乔飞笑了笑,将蒋慕轩的那段2.7kb的DNA序列,直接发送了过去。

SNP无法证明这段序列是蒋慕轩独有,只有做最后的尝试——蒋慕轩的DNA上有突变,如果有突变,就可以直接确定了。

只是会有突变的概率会很低——因为一般基因突变的人会有严重的先天疾病,就像自己的白化病,而蒋慕轩明显是健康的。

即使没报什么希望,乔飞还是决定尝试,可能是想起了秦兰的工作态度,大胆假设,小心求证。

不到三分钟,梁晓慧回复——查到了。

乔飞又一次拨通了梁晓慧的电话,还没等说什么,梁晓慧已经迫不及待的告诉他:“你手真快,我正要给你打过去的…你发我的这段DNA上,有两个点突变,是沉默突变!”

“频率呢?”乔飞问道。

“等我算算,额...都很低,一个0.04%,另一个0.6%...”

……

挂断了电话,乔飞内心掀起了一阵惊涛骇浪——实锤了!

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