马达加斯加主要矿产资源有石墨、铬铁、铝矾土、石英、云母、镍矿、钛铁、铁矿、锰、铅、锌、煤等，其中石墨储量居非洲首位。此外还有较丰富的宝石、半宝石资源以及大理石、花岗岩和动植物化石等。河流湍急，水力发电潜力大。森林面积12.3万平方公里，约占国土面积的21%，珍稀动植物种类繁多，包括珍稀植物塔那拉爵床。
马达加斯加还有不少动植物都是马达加斯加独有的，如番茄蛙，皮肤为橙红色，栖息在马达加斯加岛上的沼泽地或森林里潮湿的地方，以昆虫和小型无脊椎动物为食，其鲜艳的颜色是对捕食者的一种警告，受到威胁时，皮肤会产生厚厚的黏液来防御掠食者的攻击。任何碰到它的生物都会皮肤过敏，虽然不如美洲箭毒蛙那样致命，但是会引发长时间如同烧灼般的疼痛。
还有一种小动物叫做撒旦叶尾壁虎，分布在马达加斯加岛的中部偏东地区，是一种伪装大师，能逼真地模仿干枯的树叶，避免被掠食者发现。
全世界大约有150多种变色龙，其中三分之二分布在马达加斯加，世界上体型最大、体型最小的变色龙都在马达加斯加，国王变色龙、高冠变色龙、象耳变色龙等，都是马达加斯加岛的高光物种，在后世很受孩子们痴迷。
马达加斯加潜鸭是一种水栖鸟，世界上最稀有的鸭子之一，分布在马达加斯加的沼泽和淡水湖泊中。体圆，头大，很少鸣叫，为深水鸟类，善于收拢翅膀潜水。食性为杂食，主要以水生植物和鱼虾贝壳类为食。雄体头部通常为黑色或红色，具有金属光泽；雌体纯褐色，羽毛致密。嘴多扁平，先端具嘴甲，前趾间具蹼，后趾形小而不踏地。雌雄外形不同，雄性具交接器，尾脂腺发达，气管基部有膨大的骨质囊。
马达加斯加最为人所熟知的就要数狐猴了，这里拥有100多种狐猴，是该国最具代表性的特有动物之一，这些灵长类动物因其独特的适应性和生存环境而闻名。还有不少种类只分布在马达加斯加。有些狐猴体型肥硕，动作慵懒，萌哒可爱，也有些种类的狐猴动作迅速，非常善于跳跃，爱抢地盘。
在马岛的东北面有一座小岛（圣玛丽岛），每年7-9月的这个时间段会有大批的鲸鱼由南向北洄游到圣玛丽岛附近的海域进行交配和分娩。它们数量惊人，可达7000多头。雄性座头鲸每年约有6个月时间整天都在唱歌，而且其歌声中敲击音与纯正音的比例与西方交响乐中两者的比例非常类似。这种庞然大物至少能够发出7个八度音阶的音，但它不是毫无章法地在吼叫，而是按照一定的节拍、音阶长度和音乐短语来歌唱，非常的神奇。
座头鲸是一种大型鲸类，在海洋中也是一种庞然的存在，尤其是近距离与它们相遇，觉得震撼无比！成年座头鲸体长可达18米，体重接近30吨！座头鲸以其跃出水面的姿势、超长的前翅（鳍）和复杂的鸣叫声而闻名。当它们跃出海面，又重重地砸向海面，那种压迫感和溅起的水花随之扑面而来，令人终生难忘。
座头鲸是一种洄游动物，多成对活动，性情温顺，同伴间眷恋性很强。每年进行有规律的南北洄游：夏季洄游到冷水海域索饵，冬季到温暖海域繁殖，洄游期不进食。座头鲸还是一种喜欢玩耍的动物，它们的智商非常高。
座头鲸的配偶为一夫一妻制，雌兽每2年生育一次，怀孕期约为10个月，每胎产1仔，寿命为60~70年。孕期、产仔数和寿命跟人类极为相似。当雌兽带着幼仔时，往往另有1只雄兽紧跟其后，它的任务是对入侵的其他鲸或小船进行拦截，不过要是遇上凶恶而狡猾的虎鲸时，它就无能为力了。
像其它哺乳动物一样，雌兽用乳汁喂养幼仔，乳汁由乳头自动挤出，幼仔在水中吸食，幼仔发育很快，每天体重可以增长40~50千克，更令人惊讶的是雌兽在哺乳期间为幼仔的成长提供一切营养，而它自己却很长时间没有吃东西了，直到几个月以后才开始寻找食物。雌兽与幼仔之间也常常是温情脉脉的，幼仔用两鳍触摸着雌兽，有时好像是抓在雌兽的身上。
马达加斯加拥有多种珍贵的木材资源，包括猴面包树、红酸枝（巴厘桑）和龙血树。
红酸枝（巴厘桑）是一种名贵的红木，属于硬木的一种，因其优美的纹理和耐用的特性而闻名。这种木材的生长周期非常长，需要等待1000年才能形成优质的木材。红酸枝树的直径平均每100年增长5到8厘米，如果一棵树直径达到50厘米，那么它的年龄至少有800到1000年。这意味着，好的红酸枝木材的形成需要长时间的等待，其价值也因此而显得尤为珍贵。此外，红酸枝木材的使用价值与其年龄密切相关，只有300年以上的树龄的红酸枝才真正具有价值。
龙血树是一种耐旱的植物，适应于沙漠条件，在也门和部分非洲地区有出产，龙血树有其独特的外观，具有工业价值和药用价值。从龙血树的木质部提取出来的深红色血竭为名贵中药材品种，有散瘀止血、消肿止痛、止咳平喘、抗炎抗菌、治跌打扭伤和治疗便血的功效，主治咯血，咳面，吐血，衄血，尿血，便血，崩漏，跌打损伤，哮喘，痢疾，小儿疳积等疾症。还可以用于制作染料和香料，是一种非常宝贵的树种，寿命可达8000年之久。
在亚历山大交给帕特罗克勒斯的的《阿非利加百科》中记录了马达加斯加岛上有一种奇特的树叫猴面包树，这种植物主要分布在阿非利加的西部和中部地区。猴面包树不仅是一种常见的植物，还有着丰富的文化和历史意义。例如，在非洲有些地区，有诗人、音乐家、魔术师和史学家等过世后，葬于猴面包树空洞的习俗。此外，猴面包树因其独特的形态和功能，如储水能力强的树干和可供猴子食用的果实，而得名“猴面包树”。
它的树皮含有一种类似阿拉伯胶的物质，可以用来制作胶水和油漆。它的名字是因为它的果实是一种圆形的硬壳，里面有许多像面包一样的白色绒毛，非常好吃，是猴子和其他动物的最爱。
猴面包树是一种非常适应干旱环境的植物，它的树干可以储存大量的水分，可以在极端的干旱条件下生存。它的根系也很发达，可以深入土壤，寻找水源。它的叶子也很特殊，它们是一种针状的小叶，可以减少水分的蒸发。
它的花也很奇异，是球形的花序，由许多小花组成，颜色有白色、粉红色、红色等，花期在夏季，可以吸引许多昆虫和鸟类来帮它授粉。
猴面包树几乎全身都是宝，它的各个部分都可以利用。它的果实、叶、树皮、根全身都可以食用或入药，钙含量丰富，可以治疗缺钙，又具有消炎、退热、治疟和治疗糖尿病等多种功效，是自然的“药箱”。后世的科学家们从猴面包树中分解出一种能抑制胃癌细胞形成和扩展的物质，揭密了常吃猴面包树的非洲人几乎不患胃癌的奥秘。
它的果实是一种木质的坚果，口感酸甜，富含能量、蛋白质、钙、磷和大量的维生素c，当地居民常常将果肉晒成粉，泡水喝，解渴又营养。同时，果实还可以制作成果酱、果汁等调料。里面有许多种子，种子可以食用或者播种，还可以制作酒精、醋、酵母和精油等，它的树皮还可以制作纸张、绳索、篮子等，它的根还可以制作染料、香水、化妆品等。
猴面包树的花朵和叶片富含维生素和钙质，嫩叶被当地人当做蔬菜食用。树皮富含纤维素，可用于制作绳子、乐器弦、造纸原料。它的木材也很坚硬，可以用来制作家具、工具、乐器等。它的树冠也很茂密，可以提供阴凉和遮蔽，是人类和动物的居住和休息的地方。和龙血树一样，猴面包树的寿命也是非常之长，可达5000年之久。
如今的马达加斯加岛上总共就几千南岛人，他们主要分布在北部地区。马其顿人在贝齐布卡河与马哈赞巴河口建立了城镇，和南岛人做起了贸易，南岛人比较独立，虽然没有文字，但有自己的传承的文化，和希腊人的习俗相差很远。他们大部分人与科伊桑人一样，并不太喜欢城镇生活，他们更喜欢在沿海自由自在地过着渔民的生活。他们的技艺非常精湛，比起马其顿人、迦太基人、希腊人都要强得多，他们用鱼叉、渔网甚至徒手都能抓到鱼，同时对鱼类的习性非常了解，能轻易找到那些隐藏在石缝内的贝类，是捕鱼的高手。
不过在见识到了马其顿人的强大海军之后，南岛人个个都非常羡慕不已，虽然自诩为最善于航海的人，但相比于马其顿人的海船，他们的海船根本就不能叫作船。马其顿人各种层出不穷的“高科技”更是不断刷新了他们的认知，使得他们愿意融合到他们的大家庭中来。
于是，马其顿人招募了不少南岛人作为水手，在城镇的海岸边建立起了船坞，制造渔船和小型海船。非洲这边缺乏制造大船的大型乔木如冷杉、铁杉、赤松和温带柚木等，所以只能用非洲柚木制造一些20米左右的小型海船，用于近海捕鱼和横穿海峡进行近海贸易。