除了内阁则例之外，朱载坖还要求制定六科则例和选官则例，六科则例自然是要要求六科的执掌和各种禁止性的规定，主要是要求六科回到之前的天子近侍的地位上来。
而选官则例则是针对大明混乱的选官制度，大明的选官，尤其是文官的晋升看似有严密的制度，实则根本没有什么一定之规。
就文官的选拔任用而言，虽然大明规定的铨选机构是吏部，但是在实际操作中，内阁、科道甚至其他的官员和部门对于吏部的影响实在是太大了，廷推、会推又没有一定之规，吏部的铨选之权没有保障。
现在朱载坖既然要厘清个衙门的执掌，作为六部中最重要的吏部肯定是要首先明确的，吏部的铨选职能主要是由部推和部选实现的，按照大明的旧制，京官五品以下及在外四品、非方面者，则吏部先定其职任，然后奏闻，吏部部选的对象主要是听选官和考满官员。
朱载坖认为，以前的制度还是过于宽泛了，对于什么官缺应该怎么推选，还是没有一定的规定，朱载坖在和阁部重臣商量之后，认为把大明的官缺分为三等。
第一等是部选官缺，两京侍郎、少卿、佥都御史以下，地方布政使、按察使以下，军中总兵、都指挥使以下，由吏部会同相关衙门，如兵部等按照官缺选任官员，然后具折陈奏，由皇帝圣裁之后予以批准。
第二等是推选官缺，地方布政使、按察使、巡抚、总督、总兵、提督、两京六部尚书、侍郎、少卿、正卿、佥都御史、副都御使、都御史等，还有顺天府尹、应天府尹、南北直隶的知府、各省会的知府，军中的总兵、都指挥使等都属于推选官缺，即由吏部召集相关衙门的官员，以投票的形式，选出正副推，由皇帝圈选人选。
第三等就是简任官缺，内阁辅臣、六科给事中、经略督师、提督、近侍官员、总协京营戎政、内廷太监、京营、亲军诸卫指挥使、参将以上将领、锦衣卫堂上官、詹事府、翰林院官员，这些都是皇帝的天子近臣，直接由皇帝下旨任命，与吏部无关。
当然，朱载坖虽然将内阁辅臣列入了简任官缺，但是朱载坖还特别规定了内阁辅臣的选任形式有两种，第一就是直接由皇帝特旨任命，第二就是由皇帝下旨，由吏部召集在京四品以上官员会推人选，然后由皇帝圈选。
这样人事权该回归吏部的回归吏部，重要的岗位都由皇帝直接掌握，内阁没有人事权，只有建议权，这样的话，一直饱受打击的部权稍有好转之势。
除了对选官规则加以重新规定之外，还有重要的一点就是禁绝朦胧推升，朱载坖首先下旨，禁绝朦胧推升，再有朦胧推升者，涉事官员立斩不饶。
所谓朦胧推升，主要就是针对这些言官的，一旦言官因为上疏言事被贬谪惩处之后，其同党为了捞这些被贬谪的党羽，就发明了所谓的朦胧推升，推升就是指官员尚未考满就予以升迁，但是这些官员们为了党争，还搞出了所谓的朦胧推升，这就更加恶心了。
他们利用大明京官和外官之间的品级差距，再加上频繁的举荐升迁，使得这些本来被贬黜的官员反而迅速升迁，其中最典型的例子就是李三才了，万历十一年，李三才不过一个礼部主事，后升任户部郎中。后来魏允贞因为议论朝廷、违背辅臣意思而遭到皇帝责备时，李三才抗旨为他申辩，结果被贬为东昌推官。随后李三才一路升迁，从南京礼部郎中、山东佥事、河南参议、南京通政参议、大理少卿等职。
到右佥都御史总督漕运，李三才用的办法就是朦胧推升，在每个岗位，李三才都没有干满过二年，先是在地方推升，因为这个时候他才刚刚被贬，皇帝对他有印象，不能太过于高调了，从东昌推官就升任南京礼部郎中，看起来是个闲职，毕竟南京礼部能有什么实权呢？
但是这一步是很关键的，这是解决李三才的品级和京官待遇问题，南京也是京，南京官员同样也是京官，李三才的第二步就是从南京礼部郎中升山东按察佥事，从正六品升任正四品，这就是京官外放的正常待遇，也是李三才为什么要在南京礼部郎中这个位置上过渡的原因。
解决了四品的品级之后，就是想办法调任京官了，从按察佥事调布政司参议，然后再次回到了南京，担任通政司参议，看起来又是一个闲职，但是此时李三才已经从地方的四品变成了四品京官了，要知道大明一向就是京官大三级。
之后就是一番操作之后，从通政司参议调大理少卿，积攒资历，然后从大理寺推升到都察院，虽然仍旧是四品，但是正四品的右佥都御史已经具备了外放担任督抚的资格了，于是在同党们的推升之下，李三才得以顺利出任总督漕运。
一个被皇帝贬谪的六品主事，居然就在皇帝的眼皮子底下担任总督漕运这样的要职，真是咄咄怪事！
这也是朱载坖要禁绝朦胧推升的原因，朦胧推升就是党争的工具罢了，朱载坖在选官则例中明确规定，凡是被贬谪的官员，在考满之前，一律不允许推升。
不管是部选、推选还是简任官缺，在介绍候选官员的时候，都必须将官员受惩罚的情况以蓝笔添注在官员的简介上，供皇帝参考。
凡是因为失职、贪墨、妄言等事情被贬谪的，考满之后，升迁顺序排在同级官员最后。
朱载坖的想法很简单，就是要纠正现在官场的风气，各级官员为了出名搏位，大肆妄言，以受贬谪、挨庭杖为荣，朱载坖就将这些事情与他们的前途联系起来，看他们还敢不敢放肆妄言，沽名钓誉。
接下来就是制定六科则例。