刘国轩用诱敌之计打败了刘肇基，得了不少战利品，这一下手下的众将对这位年仅十九的小将军全都服气了，消息传到思明州，郑芝莞大喜，立即传令重赏刘国轩，并提拔他为参将，大批酒肉和赏银送到了前线。
刘国轩将酒肉和赏银全都分给将士，而且他对那名辎重营那名千总没有半句责备，反而进行了表彰赏赐，这名千总无地自容，因为当时他带头临阵逃跑，按律当斩，刘国轩不但没有杀他反而奖赏他，千总感激涕零。
正在他们犒赏三军，庆祝胜利的时候。有人来报，明军兵退15里，扎下营寨。
刘国轩笑了笑，没有说话。接下来一连几天，明军没有出战，后来又有人来报说明军正在四处筹积粮草。
刘国轩一听明军粮草接济不上，真是天助我也，但是心细的他遂带着人亲自察看明营的防守情况，看完之后发现，明营防守松懈，又派出细作打探，探子回来禀报，明军兵将士气低落还颇有怨言，根本没有斗志，高国轩摸清这些情况后高兴了，军中粮草短却，难怪这些天明军不战原来是在等粮草，现在明营已经军心浮动，破明军大营，抓朱由崧就在今晚。
他拿定注意后，准备了三千精锐，二更天时三千人马全起来了，用过战饭，临近三更的时候，刘国轩带着三千人马悄悄地往明军大营而来。
这是个月黑风高之夜，三千人马排成了长龙，人不知鬼不觉便摸到了明营附近，就见明营营门口高悬气死风灯，明营一片死寂，站岗的抱着刀枪在那里打磕睡，也没有巡逻的兵将。
刘国轩把手中的大戟一指，“杀！”
三千人马如潮水一般，杀向明军大营，呐喊声打破沉静的夜空，明军猝不及防，站岗的哨兵被惊醒，散腿就跑，刘国轩指挥着大军一个冲锋便冲进了明军大营。
他们见人就杀，明军从梦军惊醒，四散逃奔，刘国轩事先已经探听清楚，指挥着人马往御营杀来。几乎没遇到什么阻挡，轻而易举地便冲进了御营之中。
此时御营中灯还亮着，这便朱由崧的御营大帐，刘国轩指挥人马冲进御营，此时营账中坐着一个人，一身龙袍，正在案边翻看书卷，神情怡然，专心致志的样子，视刘国轩等人如无物，正是朱由崧。
“昏君，还不束手就擒？”刘国轩在马上用戟一指。
看到刘国轩带人冲进来了，朱由崧这才把卷放下，哈哈一笑：“刘国轩，朕等你好久了！”
朱由崧话音未落，外面号炮连天，无数年的火把照耀下，四周扑天盖地全是明军，刘国轩的人马早已经被包围在御营之中。
刘国轩这才知道上当，原来一切都是假像，但是事到现在他也豁出去了，摧马执戟直取朱由崧。
朱由崧坐在案前动都没动，战马冲进来，大戟如破空而来直刺朱由崧的面门。
朱由崧把头一摆，让过戟锋，伸手把戟杆抓住，“下来！”
朱由崧往回一扯，刘国轩在马上坐立不稳，翻身落马，还没等他起来，已经被冲过来的三员女将逼住，“别动！”正是马金花，贺宣娇、慧梅。三把刀剑之下，刘国轩只得束手就擒。
刘国轩的三千人马，除了几个死心眼的被斩杀之外，余者大部分选择了投降保命，三千偷营之敌无一人漏网，战事很快结束。
朱由崧仍坐在案边，对绑在他面前的刘国轩道：“朕爱惜你是个才人，投降吧，朕可以既往不咎，并让官复原职。”
刘国轩立而不跪，誓死不降。
“你这是不服呀，好吧，来人，把他放了。”
好不容易把他捉住了，就这么放了？明军将士不解，但哪敢多言，绑绳被松开，战马和大戟都给了他，刘国轩执戟上马，飞马而去。
“陛下，因何不杀了他？”小柳是道。
“杀了可惜了，朕要收降他。”
“可是他根本不降。”
“那是未到火侯。此将乃可塑之材，我大明需要这样的人。”
“陛下求贤若渴，柳是佩服。”
朱由崧笑了，命人收拾营帐。
刘国轩出了明军大营，回到自己的营中，天已经快亮了，三千人马只剩下他一个光杆司令。现在他的大营连后勤营都算上总共还剩下一千多人，众寡太过悬殊，他带着一千多人连夜拔营起案撤回思明州。
刘国轩自缚其绑来向郑芝莞请罪，郑芝莞叹了口气，也没怪罪于他，亲自把绑绳解开，安慰了他几句，让他回营休息。
两天之后，明军数万大军兵临城下。
郑芝莞坚守不战，问计刘国轩。
刘国轩思忖道：“大人，朱由崧诡计多端，我军新败，士气低落，加上兵微将寡，如果明军用大炮攻城，城池怕是守不住了，我们不如放弃思明州，退守厦门岛。我们的优势在海上，在海上收拾他们。”
郑芝莞点了点头，但仍不无顾虑道，“将军言之有理，只是我们弃城而逃，王爷将来要是治我等不战而逃之罪，当如何是好？”
“大人，胜败乃兵家之常事，再说了我们并非不战不逃，这是以退为进之策。撤退只是权宜之计，死守城池，必然全军覆没，城池不保。退守厦门保存实力，只要海战能取胜，我们还有复夺思明州的机会。”
“海战如何打法？明军的水师已经拿下了浯屿礁和双鱼岛。”
“大人，这好办，我们在鼓浪屿设置炮台，然后在四周最狭窄的浅水区修建拦网护网，可破明军水师。”
“好，就依将军之言。”郑芝莞高兴了，立即按照刘国轩的计策，放弃了思明州，将人马撤到了厦门岛上。
明军占领思明州，朱由崧传旨，留下一万人马守城，处理城中战后事宜，然后马不停蹄，督率明军的大队人马开到了海边，安下营寨。
这里最窄处离厦门岛不足十里，朱由崧带着人登高一望，能够清楚地看见对岸深沟高垒的防御工事，炮台战船，戒备森严。
如果把水师调过来，在强大火力的掩护之下，从这里抢岛登陆不是难事，但是此时明军的水师被阻在双鱼岛一带，离这里还有几十里地，水师可从岸上绕过来，但战船却飞不过来，临时造船，耗资甚大，时间也太长。
此时明军和守岛的人马正在进行激烈的海战。