那么刘行想到的商团军编制是怎样的、又有何新花招呢？
新编制的方法上，首先刘行让种师中在《额定招募令》中明确一个新铁律、所有商团军中都增设政训主官的职务。团以上设政训督导员，建立政训处、科。营以下设教导官、教导员。
政训官全部将由兵部直接任命，是代表朝廷到各商团军中去执行政训督导的。其职责，就是确保所有商团军的军心所向永远忠诚于北朝，并且作为朝廷监督商团军的政治主官。
商团军的团长、营长、连长都是没有品秩的，政训官却是朝廷委派的。刘行相信单从这一点上，有官身的人压制那些没品秩的人，只要用人得当就一定会达到牢牢控制商团军的目的。
增设政训官之外，编制上也是一大手段。一个营满编不得超六百五十人，一个连不得超一百五十人。连一下的排为三十三人死定额，班为十人基本定额。
以编制员额遏制住商团军发展的规模，直接斩断了商人们可能做出来那种肆意招兵、有钱就有兵的情况出现之可能。
为了使日后商团军军官可能转入皇家部队时减少麻烦，刘行又明确为商团军确定出了少将、准备将、上校、中校、少校、准备校、上尉、中尉、少尉、准备尉的十阶军衔制。兵士则分为一到六级军士长、上士、中士、下士、一等兵、二等兵、列兵的十二等军衔制。
给各级军衔的人发多少钱是商人的事，但那些商团军想要转入到皇家部队时，则首先要看其必须经过定期核试、朝廷先确定好的军衔来确定其谴往何处、委以何用。
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那么刘行到底想要怎样控制商团军的规模呢？做法有三点。
第一种做法，种师中与宗泽已经在方才的商谈中同意。那就是推行商团军州府县额定招募权制度。
何为额定招募权呢？就是每一个县，无论你有多少有钱的富商，兵部以后都只会发给该万户县一个连的招募权。三万户的县。给其一个营的招募权。五万户及人口更多的县，给其最多两个营的商团军招募权。
但是呢。在遏制各地那些商人的时候，刘行还给自己留下了一个漏洞：凡枢密院特准者，可自行扩招。
这是什么意思呢？这就是说只有枢密院特准的商人，才可以超出这种基本的额定去招募、组建大规模的商团军。
可是枢密院的知事是刘行、同知事是种师中和宗泽。这种大权牢牢掌握在三人手上，那些商人就算花再多的钱，都别想得到特准扩招权了……
名义上，刘行让种师中在颁布《额定招募令》的时候要宣称是“不以战为首要事，不以兵务废百业。”
这是何意呢？就是告诉天下人：不能光为了打仗就把壮丁、好汉子全都弄去征战沙场而荒废了其他的百业。
这个借口一出。种师中、宗泽相信任由那些商人再是如何地精明，也是绝对想不出办法来反驳了。
遏制商团军第二个做法，刘行决定彻底将那些私人军队中的各级将佐全部私人化，直接斩断其私转官的可能。
详细的做法是刘行重新定立出了一套规则：商团军中各级兵士只有在其原来队伍中服役五年以上才有资格加入皇家部队，但是加入以后却仍然按新兵、从最低级的士兵重新做起。
那些商团军中的军官相对于兵士要好一些，但是凡商团军之将佐欲入皇家部队者，都必须先自费进入讲武堂深造。深造完成，加入皇家部队时还要先以降职三级、重新开始
第三个做法，就是刘行方才对苏权所言的、另立新制，将商团军从编制上与皇家部队直接分开。
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“啊？”一听这话，苏权更加惊诧不已。盯住刘行道：“太傅您是要在我朝现行军制之外，专为商团军再定一套商团军军制出来吗？遏制商团军发展，你想要如何遏制呢？”
商团军这个主意是刘行想出来的，事实证明商团军的出现确实给北朝如今塞北和草原的战事，乃至于西域的战事起到了很大的帮助。
发动民间力量，以商人之财资助其私军去帮助朝廷攻城略地、开疆拓土。这个想法是好的，至少至今满朝已无人为此事再表示过担忧。
然而满朝文武只看到了岳飞和杨沂中利用商团军做了炮灰，实际上并未给商团军太多开疆拓土、为其家主打出土地然后使其家主受封贵爵，都看出来了刘行这等于是在赤果果地给那些趋利贪婪的商人挖了一个巨大的坑。
可是那些大臣们却并未想到。就在他们开心于商团军减少朝廷度支、却为草原与塞北战事真的增加必胜了能的时候，刘行却想到了更远、更长久时间后可能会出现的负面效果。
商人、十商九奸。刘行很清楚自己挖的商团军那个坑暂时是把那些奸诈、贪婪的商人给坑了。
可是一旦那些奸商反思、清醒过来。看穿了那是一个大坑。商人们在狗急跳墙之时，必然会产生两种可能性的反效果。
相对好一些的负面效果是商人停止资助商团军。坏的负面效果则极其可能便是几个、几十个甚至更多的商人为其自身利益，私下勾联到一起举兵公然向朝廷要说法。
如果是前一种负面效果，大不了朝廷接管商团军、优胜劣汰选出一些能征善战的兵士全部收编纳入皇家部队中去。
可若是真的演变出第二种负面效果，刘行可不希望才攘外完成、马上自家后院又起火，让中原天下的万民又陷入到内斗的泥沼中去……
所以刘行在决定自己要建商团军的同时，也想好了要给那些商人招募的兵力做一个控制。
只有控制好商人可以掌握的兵力，才能最大程度上避免第二种负面效果的出现。即便是日后出现，只要遏制的好、也最多只是会变成一场又一场内战练兵，不至于真的变成大规模兵祸。
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