经过乔伊小姐的介绍后，众人知道了凑巧遇到了妙蛙种子进化的庆祝祭典了。
小刚望着窗外的鲜花，说道：“看来我们好像是迎接了重要的时刻了。”
“进化是在哪里发生的呢？”小霞好奇的对着乔伊小姐问道。
乔伊小姐甜甜的说道：“在被称为不思议花园的地方哦！”
小刚：“是在不思议花园吗？”
芽衣：“不思议花园？”
乔伊小姐：“对，可是到目前为止，从来都没有人看过那个地方，所以甚至被认为只是幻影呢！”
小霞：“我不认为这些花是幻影，我相信不思议花园一定是在某个地方才对。”
“对呀，小亮，到时候我们一起去看看吧？”芽衣抬头看着小亮，她觉得跟着小亮的话，一定会找到不思议花园的。
小雪、奇鲁莉安和已经从窗户外边回来的灵儿都期待的看着小亮。
小亮点头应着：“嗯，要是真的有这个地方的话，我们就一起去看看。”
小智：“不思议花园啊，我也好想看一看。皮卡丘，你也这么认为对不对？”
“种子！”在检查室中的妙蛙种子听到了小智的话，坚定的叫了一声，似乎是在强行忍着什么。
然后，众人回到各自的房间中休息了。
晚上，当众人都熟睡后，皮卡丘小智的妙蛙种子突然被不知名的力量牵引着走出了精灵中心，而皮卡丘被妙蛙种子给惊动了。
之后，妙蛙种子被它的同类妙蛙种子捆绑，向着不思议花园前进，而皮卡丘急忙跑回来叫小智。
正在隔壁房间睡觉的小亮和奇鲁莉安听到了皮卡丘的声音和小智的惨叫声。
皮卡丘对着小智使用放电技能：“皮卡，丘～”
小智：“啊...啊！”
“嗯？”小亮顿时清醒了过来。
“奇鲁？”奇鲁莉安揉了揉眼睛，疑惑的看着已经醒来的主人。
随后，小亮大喜，因为他估计小智的妙蛙种子应该是前去不思议花园了，然后把怀里的三个媳妇儿叫醒。
没错，现在灵儿可以从灵魂之链中出来后，几乎是无时无刻都黏着小亮，包括小亮洗澡的时候。
起初，小亮还很害羞，不过现在也习惯了，让自己的媳妇儿看看怎么了，又不会少块肉。
“芽衣，小雪，灵儿，起床了，我们要去不思议花园了。”
“嗯？”
在隔壁房间。
小智直接被皮卡丘电得倒立在上下床的木梯上，场景很是诡异。
小霞：“吵死了，小智！”
小智依然倒立在木梯上，无语的问着皮卡丘：“干什么了，皮卡丘？”
“皮卡！皮卡～”皮卡丘对着小智着急的叫了一声，然后双手着地，在地板上模拟着妙蛙种子的动作。
小智立刻就听懂了皮卡丘说要表达的意思，急忙从木梯上下来，对着皮卡丘问道：“你是说妙蛙种子它出事了？”
皮卡丘点头：“皮卡！”
踏踏踏！
随后，小智他们急忙跑到妙蛙种子所在的检查室，但是之前妙蛙种子躺着的那个检查台已经空空如也。
小智：“啊，妙蛙种子不见了！”
踏踏踏！
“哎”
“啊，小智，你的妙蛙种子不见了？”这时，已经穿好衣服的小亮、芽衣、小雪带着奇鲁莉安走了过来。
小霞、小刚：“啊！”
小智对着小亮点头：“嗯！”
“皮卡丘，该不会妙蛙种子被...”然后，小智担心的问着皮卡丘。
“皮卡丘～”皮卡丘握着小拳头，对着小智点头着。
此刻小亮的内心是很高兴的，因为小智的妙蛙种子就是去不思议花园的契机，而且小智的妙蛙种子很安全。
但是现在小智并不知道，所以他的脸上并没有露出开心的笑容。
...
在森林中开着鲜花、被月亮照的和亮的某处道路，突然传来了哈哈大笑的声音。
“哈哈，好像做梦一样，这种美丽的景色最能打动少女的心了！”武藏双手合十，放在胸前，正在往道路上前方走着，开心的环视着周围的景色。
“是吗？我可不喜欢啊，快得花粉过敏症了。”小次郎佝偻着身子，用右手食指捂着鼻子，吐槽着。
武藏扭头看着小次郎：“你这个人还真是没有情调耶！”
喵喵急忙打断武藏和小次郎的话题：“别聊那个了，今天我们可是要挑灯夜战到天亮呢！”
武藏双手握拳，信心满满的说：“对，今天一定要把皮卡丘拿到手！”
喵喵也开心的说道：“我们绝对要让他们大吃一惊！”
喵喵、武藏、小次郎他们走着走着，就遇到了被六只妙蛙种子用藤蔓抬着的妙蛙种子（小智的）。
“种子...种子...”
“哎，这个地方竟然会有妙蛙种子！”武藏一副非常感动的模样。
小次郎握着左拳：“而且有七只耶！”
喵喵说道：“趁这个机会，把他们全部抓起来！”
“抓起来！”随后，武藏、小次郎和喵喵就这样空手冲过去，连阿柏蛇和双弹瓦斯都没有放出来。
不知道是有所依仗，还是做事不经头脑？
“种子，种子！”
果不其然，火箭队三人组被妙蛙种子们用藤蔓给抽飞了。
“啊...”
飞在空中的小次郎：“我们出场结束了吗？”
武藏：“我们什么事（坏事）都还没做呀”！
“喵！”
而后，一颗比夜晚的天空上的星星更亮的星星?出现在空中。
另外一边，小智等人穿戴整齐后，小智一行人，小亮一行人在皮卡丘的带领下，向着妙蛙种子被抓走的方向前进着。
踏踏踏！
众人来到了一个双岔路口，小智对着前面的皮卡丘问道：“皮卡丘，在哪里？”
嗅嗅！
“皮卡！”皮卡丘在地上嗅了几下，指着右边的下路说道。
我去，皮卡丘这是拥有着活脱脱的警犬卡蒂狗的鼻子啊，这都可以！
小亮：“小智，那我们过去吧！”
小智：“好！”
踏踏踏！
随后，众人在皮卡丘的带领下，继续前进着。
呜，砰！
在小智小亮他们离开这个双岔路口后，火箭队他们从天而降，直接在地上砸出了一个大洞。
洞口里面响起哎哟、哎哟的声音，接着武藏、小次郎、喵喵他们爬了出来。
武藏：“我不会认输的！”
小次郎：“我要把他们全部一网打尽！”
喵喵：“好辛苦啊！”
……
踏踏踏！
而小智小亮他们，正在皮卡丘的带领下，向着前方跑去，众人边跑边说着。
小刚：“只要顺着这些流动的花粉。”
小智：“一定可以找到妙蛙种子的！”
小霞：“一定有不思议花园！”
芽衣嘴角挂起迷人的微笑：“不思议花园，我们来了！”
小雪好奇的说道：“不知道传说中的不思议花园是怎么样的？”
灵儿待在小亮胸前的灵魂之链中，大喊大叫着：“哇哇，不思议花园，灵儿来了！”
因为要快速的跑动，灵儿只能暂时回到灵魂之链中了。不然以她现在灵魂体的速度，是跟不上小亮他们的。
小亮点头猜测着：“估计是一个非常美丽的地方吧！”
不过没有真正见到不思议花园，小亮也罢感打包票，万一是一片凄凉的地方呢！
“奇鲁！”奇鲁莉安点头赞同着主人的话。
嘶，砰！
但是，突然周围有很多类似于树根之类的东西伸展了出来。
小霞害怕的问道：“啊，这个是什么？”
小刚惊讶的说道：“整个森林都动起来了耶！啊，你们看，藤蔓想把路堵塞起来。”
然后，众人看向正前方，很多藤蔓拦在路上，即将合拢在一起，想要形成一堵藤蔓墙。
芽衣：“啊，小亮，那怎么办，我们还要去不思议花园呢。”
小智脸色凝重：“开什么玩笑嘛，无论如何，我一定要去把妙蛙种子找回来。”
小亮对着众人说道：“大家加快速度，趁着藤蔓还没有围起来，我们跳过去！”
“喝！”
……
“嘿！”
随后，小亮抱着芽衣和小雪，跳过去，奇鲁莉安飞了过去，皮卡丘、小智、小霞、小刚先后跳了过去，等众人全部过去后，藤蔓全部合在一起。把道路给堵住了。
呼～
小智松了一口气：“差一点就过不去了！”
芽衣拍了拍正在发育的小胸脯，心有余悸的看着那道藤蔓墙：“还好，我们都过来了！”
小雪点头：“嗯，幸亏我们跑得快一些。”
小刚有种恍然大悟道说道：“原来如此啊，怪不得从来没有人看过，这也难怪。”
小霞：“总之，我们必须继续向前进了。”
小亮：“说的对，来都来了，只能继续前进了。”
“皮卡！”
这时，众人的身皮卡丘的声音传来。
“怎么了？皮卡丘。”
踏踏踏！
然后，众人转身，朝着前方继续跑去。
小智：“啊！”
而后，众人在皮卡丘身后停下，看到了下方那一副令人震惊的画面。
在森林中一处宽阔的、平坦的草地上，聚集着一两百只妙蛙种子。
芽衣惊喜的看着眼前的场景：“哇，这里就是不思议花园了吗？好美哦！”
“真的哩，灵儿也觉得很漂亮呢，灵儿也很喜欢！”从灵魂之链中出来的灵儿，看着前方的景象，喃喃着。
小智：“啊，这里就是不思议花园啊！”
小亮点头：“嗯，这么多的妙蛙种子聚集在这里，看来是这里没有错了！”
“种子种子，……种子种子……”
随后，下方的平坦草地上响起了妙蛙种子们的歌声，非常的好听。
“种子种子...种子种子...”
在妙蛙种子的前方，也一颗巨大的树木，在妙蛙种子们唱歌后，大量的花粉向着前方的那颗大树聚集而去。本来干巴巴的书突然长出来了树支，并且还开花了。
“种子...种子...”
随后，之前还是翠绿一片的草地上，突然开满了鲜花，非常的漂亮。
小亮见到这种场景后，急忙打开了精灵手环的录像功能，这么美好的景色，不拍下来就可惜了。
小刚：“啊！”
小智：“哈哈，好棒哦！”
小雪：“真的好美哦！”
...
小霞：“真漂亮！”
砰，砰...！
而后，从那颗已经开花巨大的树的树洞里，响起了很大的声响。
众人疑惑的看向那边。
小智：“这声音是什么啊？”
砰...砰！
随后，一尊庞然大物从树洞里走了出来，然后慢慢的走到了树洞前方的一个巨大的平坦树桩上。
这是一只身体呈蓝绿色，头上有一对耳朵，眼睛呈橘红色，嘴里有牙的神奇宝贝，妙蛙花。
妙蛙花的身体比它的进化前身都要更大，并且它在战斗之外比它们移动得更慢，尽管它仍然是四足行走。它背上的花蕾现在盛开成一朵巨大的红色花朵，有六片巨大的带着白色斑点的花瓣，用一个棕色的树干状物支持着，看起来像棕榈树。代替它皮肤上的像补丁一样的部分，妙蛙花现在有青蛙状的疣。事实上，妙蛙花的耳朵内部现在是红色的。爪子上有三个趾，腿也变得更粗。
但是，这只妙蛙花比一般的妙蛙花大上太多了，仿佛像一尊移动的巨兽，不知道它已经活了多久了。
“种子！”妙蛙花大声喊道。
小智：“啊，是妙蛙花耶！”
小霞：“好大哦！”
芽衣：“应该说是超级妙蛙花才对！”
然后，芽衣快速的拿出了精灵图鉴。
咔叮！
“妙蛙花，种子神奇宝贝。是妙蛙草的进化型，经常在有阳光的地方定住不动，有人猜测它是在进行光合作用。”
等图鉴介绍完后，芽衣收了回去。
小刚：“光合作用啊，那么是植物了。”
小智疑惑的问道：“奇怪，我的妙蛙种子呢？”
看来，即使是与朝夕相处的小智，在看到这么多的妙蛙种子后，也不能第一时间让认出自己的妙蛙种子。
小霞提醒着小智：“对了，你的妙蛙种子额头上贴了胶布哦！”
“皮卡！”皮卡丘却是认出来了，开心的叫道。
“种子？”在前方，一只妙蛙种子疑惑的叫着。
“哈，找到了，妙蛙种子...”小智笑着，想要大声喊着自己的妙蛙种子，却是小刚急忙捂住了嘴。
小刚捂着小智的嘴边，对着他说道：“我们是不请自来的客人，你小声一点嘛！”
“对哦！”等小刚松口手后，小智点头应着。
小霞：“我们暂时看情况吧！”
小亮也对着小智说道：“对啊，小智，现在你的妙蛙种子并没有什么危险，不用担心！”
“种子！”随后，妙蛙花又一次开口喊道。
“种子！”而而妙蛙种子们也纷纷跟着妙蛙花一起喊道。
小亮、芽衣、小雪和小智等人顿时都安静了下来，他们知道，庆祝进化祭典就要开始了！