没多久，王在晋就觉得山海关前的八里铺有战略意义，便计划在八里铺新筑一座新城来防守大金。实际上，王在晋的计划中不止是要修八里铺新城，到后面还要修中前所、修宁远城，一路修到努尔哈赤家门口。
但大夏朝廷对王在晋的八里铺新城计划并不感兴趣，第一次报上去后杳无音信。王在晋不甘心，第二次再提八里铺新城计划，并请求朝廷拨给他93万两。
实际上，八里铺新城计划总长三十七里，按照科臣周希令的估算是要五百万两的。王在晋也明白，五百万两对此时的大夏财政来说，就是一个天文数字。
于是，王在晋弄了一个简陋版的八里铺新城计划，只要93万两。朝廷依然是不支持，但大夏皇帝不想挫伤王在晋的积极性，还是给了王在晋二十万两，还特意叮嘱他“斟酌节省，毋致虚糜”。
孙承宗这次巡边，专门花一天时间到八里铺现场调研，又听了王在晋的防守计划，嘴上虽没说什么，但心里深不以为然。
第二天，孙承宗调研中前，看到王在晋也准备在中前修筑，心里就更失望了。因为在孙承宗看来，中前绝非能守之地。
等到调研宁远时，兵备副使袁崇焕向孙承宗提出，一定要驻军宁远，召募辽民重建宁远城。
“袁崇焕守宁远之议，气勃勃欲起”。
袁崇焕主张守远的理由是，现在辽民起义反抗大金，被围困在十三山，如果调兵驻守宁远，可以去接应逃亡的辽民，招募其中壮者为兵；将来有机会还可以收复锦州，进而打造宁锦防线。
孙承宗听了袁崇焕的建议，便召集大家商议。对于袁崇焕守宁远的建议，大多人都是反对的，理由是宁远离山海太远了，建筑材料不好运输。
“诸臣谓孤军在二百里外，不能自存，而工料不能远及。”
而宁前道张应吾说的就更直白了，“大寇来，未有能应者”。
也就是说，并不是大家认为宁远的战略意义不重要，而是宁远离大金势力太近，修城危险，怕有“大寇来”。
而八里铺紧挨山海关，前线又有蒙古骑兵守着，修建的安全系数明显高多了。
估计这一会孙承宗快被气疯了，但还是不动声色地问，“诚然，倘我不守，而贼以一兵据宁远，以一兵据觉华，是将急之乎，缓之乎？”
众人无言。从这一刻起，孙承宗大概对辽东经略王在晋、宁前道张应吾等人，可以说是失望之极。正如孙承宗在奏章中所说的，“每一开口，千难万难，今日关上备，诚未完，当以何时可完？今日宁远事，诚难做，当以何时可做？”
接着，孙承宗又和王象乾商量，袁崇焕提出派五千兵驻军宁远，接应对抗大金的十三山辽民，你怎么看？
王象乾回答，山海关守军刚败，士气低迷，老臣与蒙古诸贝勒交好，不如请他们派三千骑兵驻守宁远前线，接应逃亡辽民。
孙承宗不久前视察过山海关，也清楚那帮兵痞是什么德行，五千山海兵远不如三千蒙古骑，便黯然同意。
“臣初与督臣象乾计，欲以五千兵据宁远，令义民望之以为归。而督臣更欲发西虏之劲者三千以为护，使诸人西来。归而安插之宁远、觉华，择其强者为兵，余即屯牧。此崇焕议，而臣与督臣更议之，众亦谓然。”
身为帝国的将士，不敢去营救帝国的子民，还得依赖外族的力量，不知孙承宗、王在晋此时心中是什么滋味。
最后，在蒙古骑兵的帮忙，十三山辽民有六千多人被救回来了。这六千人和后来陆续逃亡到宁远的辽民，成为抵抗努尔哈赤最坚定的死士。
因为，这些辽民从某种意义上来讲，他们已经死过了，而宁远又给了他们重生的机会。
虽然孙承宗心里是认可袁崇焕的意见，但并不喜欢他这个人。
“臣非谓袁崇焕辈之慷慨而不疑其喜事也。盖再三驳其议，以尽其任事之心。”
因为袁崇焕是个不守官场规矩的人，当着孙承宗的面，公开反驳王在晋、张应吾的意见，其“气勃勃欲起”，故计当时八成是拍桌子了。
张应吾是宁前道，是袁崇焕的上司。王在晋是辽东经略，是袁崇焕的上司的上司。而且，王在晋对袁崇焕有知遇之恩。
王在晋经略时，袁崇焕是以主事（闲职）的身份，入辽当榆关监军，区区六品小官而已。后来，王在晋向朝廷推荐，破格提拔袁崇焕为兵备副使（正四品）。袁崇焕的职责也从监督改为练兵。
孙承宗不喜欢的，大概就是袁崇焕顶撞上司的这种性格。倘若没有孙承宗的支持，袁崇焕在官场上大概率会被排挤成路人。
事实上，袁崇焕顶撞上司，越职行事屡犯不改。后来，天启三年时，士兵们举报副总兵杜应魁贪赃冒饷。辽东巡抚阎鸣泰让袁崇焕去调查。袁崇焕调查发现杜应魁贪赃冒饷属实，当场越权行事，直接一刀把杜应魁脑袋砍了。
这引起孙承宗勃然大怒。不过孙承宗怜惜袁崇焕之才，还是帮他压了下来。
孙承宗之所以支持袁崇焕坚守宁远的意见，还有一个重要原因，就是担心蓟镇。蓟、辽两镇毗邻京师，是帝囯的咽喉。如果蓟、辽失守，敌军将长驱直入，直奔京师。
孙承宗在巡边时，发现九边中蓟镇的兵饷最低，战斗力最弱，军备最松驰。
“旧兵之有知者心当自明，惟是各边之饷蓟门最薄，宣大粮册三等，即最下者不下六钱五分，蓟门何敢望焉。”
蓟镇东起山海关，西至居庸关，在九边中的位置极其重要，但是问题是防线太长了，大小关隘一百九十处，敌军只须攻其一处，便可入侵。
虽然如此，但蓟镇近期以来并无战事。这主要是和外围的蒙古朵颜三十六部密切相关。
朵颜三十六部的位置很重要，上接邻内喀尔喀五部，下环绕着大夏的蓟镇边境。也就是说，要进攻蓟镇，就得从朵颜三十六部的地盘上穿过。
蒙古朵颜三十六部先身叫朵颜三卫，历史上和大夏渊源深厚。自蓝玉在贝尔湖击溃蒙古主力，朵颜三卫便归降大夏。到永乐期间，朵颜三朵与大夏王朝关系非常密切，后来与大夏王朝时好时坏。
而现在朵颜三十六部和大夏相处的不错，愿意出兵帮忙守辽东。大夏朝廷之所以坚持让年近八十的王象乾担任蓟辽总督，看中的就是王象乾和朵颜三十六部不少贝勒关系很好。
但此一时彼一时。今天朵颜三十六部是大夏的盟友，明天也许是大夏的敌人。孙承宗担心的就是敌人绕过八里铺新城，通过朵颜三十六部，进攻防守更薄弱的蓟镇。
这样的话，就算八里铺新城修得再固若金汤，也无济于事。因此，孙承宗主张把防线前移到宁远，让辽西南走廊多出来二百多里的战略纵深。
“道臣有宁远之说者，夫守莫先于险厄，宁远山势合抱不过数里，形如葫芦。诚得信臣精卒，荷戟守之。可以塞暗袭蓟门之路。”
然而，真正坚不可摧的防线，既不是八里铺，也不是宁远，而在于人心。
王在晋经略辽东仅四个月。在这期间，王在晋还推荐毛文龙为平辽总兵官，又加调拨福建水军给他。毛文龙也不负王在晋厚望，以朝鲜义州为据点，沿着大金、朝鲜四百里边境，通过鸭绿江上岸骚扰大金。
这让大金不得不加派兵力驻防，也减轻了辽东正面战场的压力。
根据《满文老档》的记录，天启二年六月，毛文龙对凤凰城、汤山、险山等处，进行了军事行动。“凤凰城、汤山、险山三处守堡具奏，毛文龙遣人乘夜前窥探，请遣千兵前来。汗命副将额克兴额，率兵二千，于十八日前往。”
天启二年八月，大夏皇帝同意孙承宗的请求，任其为督师，督理关城及蓟、辽、登莱、天津事务，成为第八任辽东分公司总经理，同时又任阎鸣泰为辽东巡抚。
但此时，不但是辽东的形势恶化，整个大夏的内部矛盾也在不断锐化，形势已危如累卵。
在孙承宗督师辽东不久后，徐鸿儒在山东巨野揭竿起义，自称中兴福烈帝。由于贫富差距持续扩大，社会矛盾日趋激化，当地农民争抢投奔徐鸿儒，起义军迅速发展到10万人。
接着奢崇明在四川永宁反叛，自称“大梁王”；安邦彦在贵州水西反叛，自称“罗旬大王”，周边响应者纷纷。一时间，三王并存。
三股反抗中央皇权的力量进一步削弱了大夏王朝的实力。而战火纷飞的地区更是一幕人间惨剧。
在叛乱中，贵阳被围半年，城中无粮可食。总兵张彦芳公开组织杀人，人肉四斤值银一两。
几个月后，荷兰人入侵澎湖，又爆发了澎湖之战。全国乱成一团粥，亡国之苗头已经出现，根本无法再像以前那样，大规模向辽东输血了。
山东巨野、四川永宁、贵州水西之乱是社会矛盾激化到一定程度的产物，而澎湖之战却是完全可以避免的。
澎湖之战的起因是大夏的闭关锁国政策——海禁。大夏开国以来，海禁便是大夏的基本国策，只许官方朝贡，不许民间贸易，只不过有时松，有时紧。
“敢有私下诸番互市者，必置之重法。”
海禁松时，沿海官吏和走私集团中饱私囊。海禁紧时，民间海外贸易便走上武装走私之路。
嘉靖年间，以日本武士、浪人为主力的倭寇之乱长达四十多年，直到戚家军的横空出世，才被基本肃清。
早在万历年间，荷兰商队代表就向大夏朝廷请求开市，进行通商，但被拒绝了。天启初期，荷兰商队为了达到通商的目的，还向福建巡抚献上荷兰大炮作为礼物。
“红夷目高文律藉通事洪庆宇为好言，献其大铳二门，小统五门为质，求互市。”
荷兰人请求贸易的目的在于谋求暴利。以丝绸为例，在大夏沿海收一百斤丝绸不过五十两，光转手卖到日本价格就高达五百两，倘若卖到欧洲贵族手中，那更是一本万利。
自古以来，来自东方的丝绸、瓷器、茶叶、金属制品一直深受海外富人喜欢。
曾经担任过福建巡抚商周祚言道，“其（荷兰商人）志不过贪汉财物耳”。这话不完全对，“汉财物”在长远的海运中也产生了新的价值。但由于物以稀为贵，大夏民间的商品一直深受西方贵族的喜欢。海上贸易成为利润最高的行业。
在通商请求被拒绝后，福建海商李锦向荷兰人献计，“漳南有澎湖屿，去海远，诚夺而守之，贡市不难成也”。
万历三十二年，荷兰人听从李锦之计，首次占据澎湖岛。当时的福建都司沈有容与荷兰人干涉，最终荷兰人撒出澎湖岛，扬帆而去。
但到了天启二年八月，不甘心的荷兰人卷土重来，正式在澎湖岛筑城，并以澎湖为据点，开始了武力走私之路，甚至公开掠夺财物。而福建守军根本无力阻挡荷兰商队的入侵。
天启三年，福建巡抚南居益向当时的福建大海盗李旦请求帮助（官方的说法是招安）。听闻李旦有意帮助大夏朝廷，荷兰商队首领高文律害怕起来，派出使者团有意讲和。
在李旦的撮和下，南居益和荷兰使者团在厦门谈判。结果，南居益在宴会上设伏，杀了荷兰使者团。这让高文律勃然大怒。
“居益使人招旦（李旦），说携大泥咬留吧。贼帅高文律惧，遣使求款，斩之。”
天启四年正月初二，福建巡抚南居益派王梦熊率福建水师进攻荷兰人。两方正式开打。虽然福建水师有一万人，而荷兰人仅九百余人，但收复澎湖却十分艰难。
从正月初二到六月十五，福建水师和荷兰人在海上激战三次。虽然澎湖岛并不能打下来，但荷兰人首领高文律意外被俘虏了。